Rok 2019. Mieszkańcy ukrytego pod ziemią, sterylnie czystego i nieprzerwanie monitorowanego ośrodka wierzą, że są jedynymi ludźmi, którzy ocaleli z katastrofy ekologicznej. Specjalne służby kontrolują każdy ich ruch, dbają, by nie wiązali się uczuciowo. Jedynym wybawieniem dla wszystkich i zarazem największym marzeniem jest wygrana na loterii - nagrodą ma być podróż na jedyną wyspę, która ponoć nie uległa skażeniu. Z czasem jeden z dociekliwych mieszkańców ośrodka, Lincoln Six Echo, nabiera podejrzeń, co do otaczającej go rzeczywistości. Odkrywa wielką mistyfikację. Władze starają się ukryć zbrodnicze praktyki - klonowanie ludzi dla organów. Przyjaciółka Lincolna, Jordan Two Delta, zostaje jako następna wybrana do wyjazdu na wyspę, Lincoln robi wszystko, żeby do tego nie dopuścić. Wspólnie decydują się na ucieczkę w nieznane. Jednak instytut Merrick Biotech, zajmujący się klonowaniem, nie pozwoli im tak łatwo opuścić ośrodka. W pościg za uciekinierami rusza elitarna jednostka.