Na planecie Diuna nadszedł czas zmian. Wskutek nawadniania i sadzenia roślinności zmniejsza się obszar pustynny. Giną czerwie i "przyprawa" - poszukiwany w całym galaktycznym imperium narkotyk. Arrakin, stolica Diuny, to dom imperatora - Paula Atrydy Muad'Diba (Alec Newman). Dzięki jego proroczym wizjom dokonano wielu podbojów na innych planetach. Teraz wyrusza on na pustynię, pozostawiając władzę w rękach opętanej siostry Alii (Daniela Amavia). Rządzi ona w imieniu dzieci Paula - bliźniąt, które kiedy dorosną, zmienią na zawsze oblicze Diuny i wszechświata. Pomoże im w tym zakon Bene Gesserit Alia (Daniela Amavia) coraz bardziej traci nad sobą kontrolę. Sytuację pogarsza wojna domowa, która wybucha pomiędzy Fremenami. Przygotowujący się do ślubu z Ghanimą (Jessica Brooks) Farad'n Corrino (Jonathan Bruun) zdradza Alii, że to jego matka, Wenesicia (Susan Sarandon), stoi za planem zabicia Leto (James McAvoy). Tymczasem prawowity władca tronu powraca z pustyni z nadludzkimi możliwościami. Na swojej drodze spotyka tajemniczego mężczyznę, który informuje go, o nadchodzącej przyszłości i poświęceniach na jakie będzie musiał się zgodzić. Razem wracają do stolicy Arrakeen.